| 年份 | 软科中国最好大学排名 |
| 2024年 | 554 |
| 2023年 | 528 |
| 年份 | 软科医药类排名 |
| 2024年 | 75 |
| 2023年 | 71 |
| 年份 | 武书连中国大学综合实力排名 |
| 2024年 | 604 |
| 2023年 | 576 |
| 年份 | 校友会中国大学排名 |
| 2025年 | 395 |
| 2024年 | 453 |
| 2023年 | 453 |
| 年份 | 校友会医药类排名 |
| 2025年 | 69 |
| 2024年 | 74 |
| 2023年 | 75 |
| 年份 | 金平果本科院校竞争力排名 |
| 2024年 | 785 |
| 2023年 | 841 |
小结： 牡丹江医科大学2025年排名全国第395位，牡丹江医科大学在全国的认可度比较高。
